Population genetic analysis and characterization of nuclear gene regions and mitogenomes in four European "Donax" species

• Autores: Jenyfer Fernández Pérez
• Directores de la Tesis: Josefina Méndez (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidade da Coruña ( España ) en 2018
• Idioma: inglés
• Número de páginas: 262
• Tribunal Calificador de la Tesis: Marcelino Pérez de la Vega (presid.), Laureana Rebordinos González (secret.), Domitília Matias (voc.)
• Materias:
  • Ciencias de la vida
    • Genética
      • Genética de poblaciones
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en: RUC
• Resumen
  • español

    La coquina Donax trunculus es un importante recurso marisquero en Europa que se encuentra en regresión en los bancos naturales gallegos (noroeste de España). Actualmente, en Galicia, sólo las cofradías de Arousa y Cedeira comercializan esta especie, poniendo de manifiesto su declive. Con el propósito de conservar, gestionar y recuperar este recurso de manera eficaz, se han realizado los siguientes análisis genéticos: En primer lugar, la evaluación genético-poblacional de bancos naturales de la Península Ibérica mediante marcadores de ADN mitocondrial (16S y Citb) para conocer la diversidad genética y la estructura poblacional. Además, ante la presencia de Donax vittatus en la costa atlántica de la Península Ibérica, como otra especie a conservar y/o gestionar, fue necesario el desarrollo de marcadores moleculares para caracterizar sus bancos naturales y llevar a cabo estudios similares a los realizados para D. trunculus. Así mismo, dada la existencia de otras especies del género Donax (Donax semistriatus y Donax variegatus) en el área de distribución a analizar, se caracterizaron el ADNr 5S, los espaciadores transcritos internos (ITS1 e ITS2), y los genomas mitocondriales en las cuatro especies objeto de estudio con el fin de obtener marcadores especie-específicos para su identificación y construir las relaciones filogenéticas dentro del orden Veneroida.

  • English

    he wedge clam Donax trunculus is an important shellfish resource in Europe that is in regression in Galician natural beds (Northwest of Spain). Nowadays in Galicia, only two markets located in Arousa and Cedeira sell this species, demonstrating the decline of this resource. In order to conserve, manage and recover this resource effectively, the following genetic analyses have been carried out: First, mitochondrial DNA markers (16S and Cytb) were used to analyse the population diversity and population structure of natural beds from Iberian Peninsula. Furthermore, the existence of Donax vittatus in the Atlantic coast of Iberian Peninsula, as another species to be conserved and/or managed, the development of molecular markers was needed to characterize its natural beds and to carry out studies similar to those conducted for D. trunculus. Likewise, given the existence of other Donax species (Donax semistriatus and Donax variegatus) in this region, the 5S rDNA, the internal transcribed spacers (ITS1 and ITS2) and the mitogenomes were characterized in these four species, in order to describe species-specific molecular markers for their identification and to construct the phylogenetic relationships within the order Veneroida.

  • galego

    A cadelucha Donax trunculus é un importante recurso marisqueiro en Europa que se atopa en regresión nos bancos naturais galegos (noroeste de España). Actualmente, en Galicia, só as cofrarías de Arousa e Cedeira comercializan esta especie, poñendo de manifesto o seu declive. Co propósito de conservar, xestionar e recuperar este recurso de maneira eficaz, realizáronse as seguintes análises xenéticas: En primeiro lugar, a avaliación xenético-poboacional de bancos naturais da Península Ibérica mediante marcadores de ADN mitocondrial (16S e Citb) para coñecer a diversidade xenética e a estrutura poboacional. Ademais, ante a presenza de Donax vittatus na costa atlántica da Península Ibérica, como outra especie para conservar e/ou xestionar, foi necesario o desenvolvemento de marcadores moleculares para caracterizar os seus bancos naturais e levar a cabo estudos similares aos realizados para D. trunculus. Así mesmo, dada a existencia doutras especies do xénero Donax (Donax semistriatus e Donax variegatus) na área de distribución a analizar, caracterizáronse o ADNr 5S, os espaciadores transcritos internos (ITS1 e ITS2), e os xenomas mitocondriales nas catro especies obxecto de estudo co fin de obter marcadores especieespecíficos para súa identificación e construír as relacións filoxenéticas dentro da orde Veneroida.