Resumen de Valor del genotipado en el diagnóstico microbiológico de la infección por estafilococos plasmacoagulasa negativos en cirugia ortopédica /
Decidir si el aislamiento de Estafilococos coagulasa negativos en los cultivos de las muestras obtenidas de cirugía ortopédica corresponde a una infección o a una contaminación es un reto altamente complicado para el clínico, puesto que se trata de un microorganismo que pertenece a la flora habitual del individuo sin provocar enfermedad. Un diagnóstico erróneo de infección o de contaminación puede suponer la realización (o no) de múltiples reintervenciones, uso prolongado de antibióticos orales e intravenosos, largas estancias hospitalarias, rehabilitación ambulatoria, aumento de visitas de seguimiento y bajas laborales.
Las técnicas microbiológicas utilizadas en la actualidad y consideradas el gold estándar para infección osteoarticular tienen una sensibilidad y una especificidad bajas. Repetitive Extragenic Palindrome PCR (rep-PCR) es una técnica basada en la amplificación y detección de secuencias repetitivas de DNA, que se encuentran en los microorganismos de forma característica. Es capaz de identificar 2 cepas como iguales con un 97% de fiabilidad y por este motivo es el método de referencia actualmente en la identificación de cepas virulentas en brotes hospitalarios y en la comunidad pero no se ha utilizado en el diagnóstico de infección osteoarticular.
OBJETIVO: 1)Determinar la concordancia de la técnica de genotipado por rep-PCR respecto a la técnica de fenotipado convencional en el diagnóstico de infección osteoarticular. 2) Analizar el subgrupo de pacientes portadores de material protésico 3) valorar el impacto del genotipado en el tratamiento de pacientes con infección por S. epidermidis 4) determinar si es posible predecir un mismo patrón genotípico entre cepas a partir del antibiotipo en los casos discordantes.
MÉTODO: Se incluyeron todos aquellos pacientes sometidos a cirugía osteoarticular con sospecha clínica de infección que presentaron ≥2 aislamientos de CoNS en los cultivos obtenidos de las muestras quirúrgicas desde enero 2011 a marzo 2015. Se recogieron datos epidemiológicos y clínicos, quirúrgicos y microbiológicos. Cada cepa de CoNS se analizó por ambos métodos (fenotipado – VITEK y API- y genotipado –Rep-PCR-). De acuerdo con las guías de práctica clínica actuales, se consideraron como patógenas, aquellas cepas de CoNS que se habían identificado como idénticas en ≥2 muestras dentro del mismo episodio. Los resultados obtenidos por ambas técnicas se analizaron estadísticamente y se compararon entre sí. RESULTADOS: Se analizaron un total de 255 cepas de Staphylococci Plasmocoagulasa negativos de un total de 52 procedimientos quirúrgicos con sospecha de infección, en 42 pacientes. Cada procedimiento quirúrgico se consideró como un episodio independiente. El 55% fueron varones, edad de 61.5 ± 20.6 años. El índice de comorbilidad de Charlson fue de 0.7 ± 1.1. En el 79% de los episodios había material protésico y el 93% había sufrido una cirugía previa en el sitio quirúrgico actual. El diagnóstico de infección por CoNS en la muestra del estudio según las técnicas convencionales fue del 73% vs 77% con rep-PCR. El índice kappa de concordancia fue de 0.59 ± 0.1 (p<0.01). En el subgrupo de pacientes portadores de material ortopédico, el índice kappa fue de 0.68 ± 0.1 (p<0.01). La sensibilidad del fenotipado vs el genotipado, calculada sobre la prevalencia de la muestra, fue del 93%, especificidad del 72%, Valor Predictivo Positivo del 90% y Valor Predictivo Negativo del 75% con IC 95%. En cuanto al análisis de las cepas discordantes, se encontraron 62 diferencias entre antibiotipos.
CONCLUSIONES: Rep-PCR detecta un mayor número de casos de infección. La concordancia entre las dos técnicas es discretamente mejor en el subgrupo de portadores de material protésico. La técnica por rep-PCR presenta además un mayor valor predictivo negativo respecto al método estandard. Según nuestros datos, no es posible predecir un mismo genotipo a partir de antibiotipos distintos.
