Diseño y desarrollo de una plataforma bioinformática para la integración, gestión y visualización de redes de interacción de proteínas e interactomas

• Autores: Diego Alonso López
• Directores de la Tesis: Javier de las Rivas (dir. tes.), Rodrigo Santamaría Vicente (codir. tes.)
• Lectura: En la Universidad de Salamanca ( España ) en 2017
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Fátima Sánchez Cabo (presid.), José Manuel Sánchez Santos (secret.), Florencio Pazos (voc.)
• Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Ingeniería Informática por la Universidad de Salamanca
• Materias:
  • Matemáticas
    • Ciencia de los ordenadores
      • Bancos de datos
    • Análisis numérico
      • Construcción de algoritmos
  • Química
    • Bioquímica
      • Proteínas
  • Ciencias de la vida
    • Biología molecular
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en: GREDOS
• Resumen

  • El trabajo de investigación que se expone en esta tesis doctoral se centra en el ámbito de las interacciones entre proteínas y la definición global de los conjuntos de interacciones presentes en cada organismo, o interactomas, en forma de redes biomoleculares. Partiendo de las diferentes bases de datos públicas sobre interacciones entre proteínas se construye un sistema de integración de dichas interacciones y se generan interactomas con diferentes niveles de calidad en función del soporte experimental de las interacciones que contienen. Toda esta información se pone a disposición de la comunidad científica a través de una aplicación diseñada a tal efecto que, entre otras cosas, posibilita la visualización y anotación funcional de las redes de interacción generadas por el propio investigador. Dicha aplicación se ha denominado APID Interactomes y está libremente accesible en la URL http://apid.dep.usal.es.