La señal clave en la regulación de los genes de la fijación en la endosimbiosis Rhizobium-leguminosas es el oxígeno el cual juega también un importante papel en la supervivencia de esta bacteria en la rizoesfera. Rhizobium leguminosarum bv.viciae posee un conjunto de genes que se expresa específicamente en condiciones microaeróbicas, tanto en cultivos como en simbiosis. La mayoría están bajo el control del regulador microaeróbico FnrN. Aunque algunos de estos genes son necesarios para el funcionamiento de la simbiosis, la mayoría no lo son, lo que sugiere que juegan un papel en el crecimiento y supervivencia de la bacteria en ambientes microaeróbicos no simbióticos, como la rizosfera o los suelos encharcados. Las funciones inferidas para los genes microaeróbicos son diversas: oxidasas terminales, transportadores de membrana, enzimas del catabolismo de aminoácidos, proteínas de homeostaris de calcio, chaperonas de diferentes tipos, reguladores, etc. Estos genes se encuentran localizados en los cinco replicones que constituyen el genoma de la cepa UPM791.
Todo ello permite concluir que la bacteria presenta un conjunto de adaptaciones específicas, en su mayor parte desconocidas hasta este trabajo, a la vida en condiciones microaeróbicas. Esta cepa, además, utiliza un sistema respiratorio ramificado con al menos cinco oxidasas terminales que se alteran en función de los niveles de oxígeno disponibles, y se interregulan de forma compleja.
Dos de estas oxidasas, una citocromo c oxidasa de tipo cbb3 y una quinol oxidasa de tipo bd, caracterizada en este trabajo juega un papel importante en el crecimiento microaeróbico en cultivo pero no en simbiosis. Por el contrario, la oxidasa de tipo cbb3, absolutamente requerida para la simbiosis, no juega un papel importante en células vegetativas.
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