El virus West Nile -WNV- (también denominado virus Nilo Occidental) es un arbovirus zoonótico emergente de distribución mundial. Pertenece al género Flavivirus y, debido a la existencia de reacciones serológicas cruzadas entre algunos miembros de este grupo, se engloba en el serocomplejo de la encefalitis japonesa, al igual que el virus Usutu (USUV), emergente en Europa desde el año 2001. El WNV se transmite fundamentalmente por picadura de artrópodos (sobre todo mosquitos del género Culex) y su reservorio natural son las aves silvestres, hospedadores capaces de desarrollar viremias suficientes como para transmitir el virus y mantener así su ciclo infectivo. Las migraciones de estas aves constituyen el principal medio de dispersión del WNV fuera de sus zonas endémicas. Además, el WNV puede afectar a un amplio rango de especies de vertebrados, desde anfibios hasta mamíferos, resultando en ocasiones patogénico en el hombre y el caballo, que son susceptibles a la infección pero no transmiten el virus. Filogenéticamente se han propuesto hasta 7 linajes diferentes de WNV, entre ellos el linaje 1 (subdivido en 1a y 1b) y el linaje 2 son los más ubicuos y han llegado a causar patogenicidad en humanos y animales. Contrastando con la gran epidemia ocurrida en EEUU (país en el se han registrado cerca de 30000 casos clínicos en humanos, con unas 1300 muertes), en Europa y Norte de África viene produciendo brotes ocasionales y generalmente autolimitantes. Estos brotes han tenido lugar sobre todo en zonas próximas a grandes humedales donde la presencia de vectores (mosquitos) y reservorios (aves) procuran las condiciones óptimas para el mantenimiento del ciclo viral. En España en particular se ha demostrado la circulación de este virus en base a la detección de genoma viral y anticuerpos neutralizantes frente a WNV en aves silvestres en el Parque Nacional de Doñana y en Castilla la Mancha.
Teniendo en cuenta el escenario epidemiológico actual en relación a WNV y USUV, no sólo en España, sino en toda la región mediterránea y Centroeuropa, esta tesis se centró en el avance de técnicas diagnósticas frente a WNV (y su diferenciación con USUV), así como en la caracterización de los primeros aislados de WNV en nuestro país. Los p rincipales logros conseguidos son los siguientes: -Se ha desarrollado y estandarizado un método de RT-PCR en tiempo real (RRT-PCR) triple de alta sensibilidad y especificidad que permite la detección simultánea y diferencial del WNV linaje 1, WNV...
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