Evaluación de técnicas basadas en el análisis de restricción del ADN genómico como métodos de tipificación de salmonella typhimurium
- Autores: Beatriz Guerra Román
- Directores de la Tesis: Mª Carmen Mendoza Fernández (dir. tes.)
- Lectura: En la Universidad de Oviedo ( España ) en 1998
- Idioma: español
- Tribunal Calificador de la Tesis: Carlos Hardisson Rumeu (presid.), Fernando Vázquez Valdés (secret.), Antonio Cueto Espinar (voc.), María de los Ángeles González Hevía (voc.), Miguel Angel Usera (voc.)
- Materias:
- Texto completo no disponible (Saber más ...)
- Resumen
Se valoraron técnicas genéticas basadas en el análisis de fragmentos de restricción del ADN cromosómico:
REA-tipificación, PFGE-tipificación realizada con XbaI, y ribotipificación con HincII, BglI, SalI, PvuII y EcoRI, como métodos de tipificación sobre una serie de 72 cepas de Salmonella enterica serotipo Typhimurium y su posterior correlación con biotipificación, fagotipificación y resistencia a antimicrobianos.
La REA-tipificación no se mostró como un buen método por bajo índice de discriminación (ID), y dificultad de interpretación de resultados. Mediante PFGE, utilizando las bandas mayores de 100 kb como criterio de separación, se definieron 26 pulsotipos, con un ID=0,87. El dendrograma de relación genética entre pulsotipos mostraba tres "clusters" y dos ramas independientes a un nivel de similitud de 0,7. Sólo las ERs HincII, SalI y PvuII se mostraron apropiadas para la ribotipificación:
13, 9 y 9 ribotipos, respectivamente, e IDs de 0,81, 0,53 y 0,59. Al combinar resultados (esquema de "ribotipificación a tres vías"), el número de ribotipos combinados (RTCs) fué de 20, aumentando el ID a 0,84. En el dendrograma de relación genética, a un nivel de similitud de 0,78, todos los RTCs de Typhimurium quedaban agrupados en un único cluster. Ambos métodos permitían la diferenciación de cepas adscritas a los fagotipos más frecuentes y de las no fagotipificables. Se encontró cierta correlación entre los tres métodos (PFGE-tipificación, ribotipificación a tres vías y fagotipificación).
La combinación de resultados de PFGE-tipificación, "ribotipificación a tres vías" y fagotipificación diferenció 46 líneas clonales, 42 de ellas presentes en Asturias; las tres líneas más frecuentes pueden considerarse endémicas, por incluir organismos patógenos recogidos a lo largo de la última década. Otras líneas parece que tienen menor incidencia en la salmonelosis humana.
