En esta tesis se plantea el estudio de los diferentes patrones de flujo génico en poblaciones de salmónidos, en especial, de la trucha común y el salmón atlántico. Se estudió la estructura poblacional del salmón en las poblaciones del norte de España y sur de Francia determinándose la presencia de una única población panmíctica. Se analiza la contribución de las repoblaciones alóctonas en la determinación y mantenimiento de esta estructura genética y el éxito relativo de los diferentes stocks utilizados en repoblaciones. Para la trucha común se estudió el papel del flujo génico en el mantenimiento de poblaciones afectadas seriamente por la fragmentación de hábitat. Se determinó la existencia de elevados niveles de flujo génico entre poblaciones adyacentes. Gracias a la existencia de poblaciones experimentales en el Archipiélago de Kerguelen se estudiaron los patrones de flujo génico y colonización de diferentes stocks de trucha común, tanto de origen salvaje como criadas en cautividad. Por último, se investiga la posibilidad de flujo génico interespecífico entre la trucha común y el salmón atlántico, así como la simetría de las barreras reproductivas entre ambas especies.
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