Estudios estructurales y funcionales del efector de legionella pneumophila sidd

• Autores: Igor Tascon Villaño
• Directores de la Tesis: Aitor Hierra Ayuela (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad del País Vasco - Euskal Herriko Unibertsitatea ( España ) en 2013
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Miguel Angel Trueba Conde (presid.), Fernando Moro Pérez (secret.), Ramón Hurtado Guerrero (voc.), María Elena Cabezón Navarro (voc.), Francisco José Blanco Gutiérrez (voc.)
• Materias:
  • Química
    • Bioquímica
      • Biología molecular
      • Proteínas
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• Resumen

  • La modificación postraslacional que consiste en la unión covalente de una molécula de AMPal hidroxilo de la cadena lateral de una tirosina o una serina, es conocida como AMPilación.Esta modificación ha reaparecido con el descubrimiento de varias proteínas virulentas,efectoras de bacterias Gram negativas como Vibrio parahemolyticus, Histophilus somni yLegionella pneumophila, que modifican pequeñas GTPasas de las células huésped paracontrolar el tráfico vesicular. Sin embargo, la única proteína virulenta conocida capaz dellevar a cabo el proceso de deAMPilación es el efector de Legionella pneumophila SidD. Eneste trabajo se presenta la estructura cristalográfica de la región catalítica de SidD (SidD-NT)a 1.6 Å de resolución. La estructura cristalográfica muestra un plegamiento de fosfatasa conmodificaciones para la adecuación al nuevo sustrato. Su actividad catalítica es estrictamentedependiente de los iones Mg2+ situados en el centro catalítico. Mediante análisiscomputacional se ha generado un modelo de reconocimiento de Rab1 mediante SidD en el quese han identificado unos residuos claves en la interacción. Se ha identificado un segundodominio SidD-CT responsable de la localización de SidD en la membrana de la LCV(`Legionella containing vacuole¿) durante la infección de la célula huésped por Legionellapneumophila.La combinación del estudio cristalográfico y de SAXS para la proteína entera harevelado que SidD presenta flexibilidad entre sus dos dominios que puede resultar crucial parala adecuación de la molécula de AMP de la Rab1 al centro catalítico de SidD.