Modeling and simulation of interlocus gene conversion

• Autores: Diego Andrés Hartasánchez Frenk
• Directores de la Tesis: Arcadi Navarro Cuartiellas (dir. tes.)
• Lectura: En la Universitat Pompeu Fabra ( España ) en 2016
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Fyodor A. Kondrashov (presid.), María del Mar Alba Soler (secret.), Laurent Duret (voc.)
• Materias:
  • Ciencias de la vida
    • Genética
      • Genética de poblaciones
    • Biología molecular
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• Resumen

  • Regiones duplicadas del genoma, como las duplicaciones de segmentos (SDs), son una característica común a todos los organismos eucariotas y han sido asociadas a cambios fenotípicos. Dada su relevancia evolutiva, tener un modelo neutro para describir su evolución es esencial. En esta tesis, describo el desarrollo de SeDuS, un simulador computacional de la evolución neutra de las SDs. Las duplicaciones sufren un tipo de recombinación conocida como conversión génica entre loci (IGC), que afecta los patrones de diversidad y de desequilibrio de ligamiento adentro y entre duplicaciones. Describo los efectos de sobreponer entrecruzamiento con regiones susceptibles a IGC y de incorporar una dependencia en el grado de similitud de las secuencias a la IGC. Adicionalmente, dado que las SDs son un blanco potencial de la selección natural, describo la distorsión que la IGC puede tener en pruebas estadísticas de selección cuando éstas se aplican a duplicaciones. Finalmente, exploro la posibilidad de combinar los resultados de diferentes pruebas estadísticas para detectar la presencia de duplicaciones colapsadas.