Estructura de la exonucleasa trex 1

• Autores: Marina Brucet Vinyals
• Directores de la Tesis: Antonio Celada Cotarelo (dir. tes.), Jorge Lloberas Cavero (codir. tes.)
• Lectura: En la Universitat de Barcelona ( España ) en 2006
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Ignacio Fita Rodríguez (presid.), Annabel Fernández Valledor (secret.), María Jesus Macías Hernández (voc.), Enrique Querol Murillo (voc.), Andrés Aguilera López (voc.)
• Materias:
  • Ciencias de la vida
    • Inmunología
• Texto completo no disponible (Saber más ...)
• Resumen

  • El objetivo general de la tesis realizada ha sido la caracterización de la proteína Trex 1, una exonucleasa que parece desarrollar un papel importante en células de sistema inmunitario. Los estudios realizados con esta finalidad se pueden dividir en tres grandes bloques:

    1,- Determinación de la estructura tridimensional de Trex 1.

    Se ha determinado la estructura tridimensional de Trex1. Se siguieron métodos cristalización y difracción de rayos-X para llevar a cabo este objetivo.

    Los resultados mostraron que esta proteína presenta una estructura homodimérica que posiciona los centros activos de cada monómero en extremos opuestos de la cara frontal del dímero, y que la organización del centro activo de Trex1 presenta elevada similitud con los centros activos de las exonucleasas de la familia DEDDh cuya estructura ha sido determinada. Además, la estructura de Trex1 ha sido determinada en presencia de un nucleótido deoxitimidina monofosfato en cada uno de los centros activos, en dos condiciones distintas: en presencia de iones de litio, y en presencia de iones de magnesio. Los iones de litio inhiben la actividad de Trex1 probablemente mediante la inhibición de la transferencia electrónica necesaria para la reacción. Además, provocan un ligero cambio de orientación de algunos residuos del centro activo. El análisis de la estructura ha permitido también identificar un posible nuevo residuo catalítico no identificado hasta el momento en las exonucleasas de la familia DEDDh, la histidina 124. Finalmente, se ha identificado un motivo poliprolina en Trex1 candidato a intervenir en la interacción con otras proteínas a través de dominios SH3.

    2,- Interacción de Trex1 con el DNA.

    El objetivo fue determinar las secuencias de DNA para las que Trex1 presenta mayor afinidad, seleccionando aquellas que mejor se unían a la proteína. Para ello, se utilizó la técnica de selección de los sitios de unión. Se observó que Trex1 prese