El chirimoyo es un frutal infrautilizado con un claro nicho de expansión en zonas de climas subtropicales. Para realizar estudios de identificación y diversidad en esta especie se han desarrollado 97 microsatélites polimórficos a partir del ADN del genotipo español "Fino de Jete" tras la construcción de dos genotecas enriquecida en secuencias CT/GA. 16 de estos marcadores, se han empleado par la identificación varietal de las 279 accesiones de chirimoyo del banco de germoplasma de la Estación Experimental La mayor, identificándose 267 perfiles genéticos, de los cuales 258 son genotipos únicos y el resto corresponden con supuestos casos de sinonimias o errores en el etiquetado.
El análisis UPGMA utilizado para determinar la relaicón genética de los genotipos mostró algunos grupos de acuerdo a su origen geográfico. La distribución de la diversidad genética de las 148 accesiones recolectadas directamente en el campo, en la supuesta zona de origen, en Ecuador y Perú se realizó mediante análisis de la varianza molecular (AMOVA), y mostró que la mayor parte de la variación ocurre dentro de los valles en cada país. Con el objetivo de optimizar la gestión del banco de germoplasma, se ha seleccionado un subgrupo de 40 accesiones (14%) de las conservadas en todo el banco de germoplasma, que contiene toda la variabilidad representada en la colección total con los loci y alelos estudiados. Para facilitar la transferencia de resultados entre laboratorios se ha propuesta una batería de 20 SSRs de referencia, que pueden favorecer le mantenimiento y explotación tanto de las colecciones ex situ e in situ de germoplasma de una forma coordinada entre los distintos países que contienen los recursos genéticos de esta especie. La elevada transferencia de los loci a especies de la familia Annonaceae y la secuenciación de los dos de ellos (LMCH9 y LMCH10) en 8 especies del género Annona y una del género Rollina, ha dilucidado importantes cambios tanto en
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