Resumen de Cristalización de péptidos básicos con fragmentos de ADN y estudio estructural de d(GCGAATTCG) a resolución atómica
el objetivo de la presente tesis era el estudio del ADN en presencia de otras moléculas tales como drogas, iones y péptidos básicos. Se logró determinar la estructura de un fragmento de ADN en forma B a resolución atómica mediante cristalografía de rayos X, la resolución más alta hasta entonces obtenida para un B-ADN. Esta alta resolución nos permitió realizar un estudio muy detallado de la estructura de los B-ADN, que de hecho es la conformación que se encuentra en los núcleos de los organismos. También se realizó un análisis detallado de los iones y la hidratación que envuelven a esta estructura. Se observó que la hidratación en el surco estrecho del ADN se puede describir en términos de capas de hidratación, formando unas redes de moléculas de agua muy ordenadas. Se comprobó que la hidratación y los iones era mayoritariamente los responsables de la compactación del ADN y de la estabilización de la estructura cristalina, neurtralizandola carga negativa de los grupos fosfatos del ADN.
Por tanto, eran los auténticos responsables de sus estructuas secundaria y terciaria. Además, el agua tiene una importancia esencial en los procesos de reconocimiento entre macromoléculas. Aparte de las peculiaridades de la hidratación,la resolucióna tómica también permitió observar que un mismo ADN puede adoptar conformaciones alternativas, y mantener a pesar de todo un empaquetamiento ordenado. Esto demostraría una vez más la gran flexibilidad que el ADN puede adoptar en los procesos de reconocimiento molecular, en los procesos transcripcionales de la célula, o bien simplemente en el empaquetamiento que el ADN presenta en el núcleo celular.
Paralelamente, se quería profundizar en el modo de interacción de la histona H1 con el ADN, responsable de la condensación de este útlimo en fibras de cromatina de 30nm. Con esta finalidad se critalizaron complejos de ADN conpéptidos básicos que simulaban la región C-
