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Resumen de "caracterització de les propietats electróniques i nuclears dels ponts d¿hidrogen de barrera baixa: un recorregut des de les molécules en fase gas fins la catálisi enzimática

Mireia García Viloca

  • El objetivo de la tesis se centra en el estudio teórico de un caso especial de puentes de hidrógeno llamado Puentes de Hidrógeno de barrera baja(Low-Barrier Hydrogen Bonds, LBHBs en ingles), a los que se atribuye un papel catalítico muy importante en algunas reacciones enzimáticas. Hemos estudiado las propiedades electrónicas y nucleares de sistemas modelo que contienen un LBHB en fase gas, mediante cálculos cuánticos electrónicos i nucleares. También se ha investigado el efecto del disolvente en la simetria de un puente de hidrógeno intramolecular que és un LBHB en fase gas. Hemos comparado los resultados de un modelo que representa el disolvente como un continuo polarizable con los resultados de un modelo donde se representan explícitamente las moleculas de disolvente. El modelo discreto se ha construido mediante la metodología QM/MM. Finalmente hemos simulado la reacción catalizada por el encima mandelato racemasa. Concretamente, se han calculado los perfiles de energia potencial QM/MM de diferentes mecanismos de reacción en el centro activo del enzima nativo de un mutante. El objetivo de este último estudio ha sido clarificar el papel catalítico de un puente de hidrógeno que se ha propuesto como LBHB.


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