El virus de la rotura del color de la flor de pelargonium: caracterización de su genoma, análisis de su variabilidad molecular y estudio de elementos en cis relevantes en replicación

• Autores: Patricia María Rico Tortosa
• Directores de la Tesis: Carmen Hernández Fort (dir. tes.)
• Lectura: En la Universitat Politècnica de València ( España ) en 2006
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Ricardo Flores Pedauye (presid.), Vicente Pallás Benet (secret.), Santiago F. Elena (voc.), Pedro Moreno Gómez (voc.), Jesús Navas Castillo (voc.)
• Materias:
  • Ciencias de la vida
    • Virología
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• Resumen

  • El objetivo general de esta tesis doctoral ha sido el análisis de relaciones estructura-función en el virus de la rotura del color de la flor del Pelargonium (Pelargonium flower break virus, PFBV), uno de los patógenos virales con mayor prevalencia en especies del género Pelargonium. Como primer paso para llevar a cabo este análisis se determinó la secuencia nucleotídica completa del RNA genómico (gRNA) viral, que está constituido por 3923 nucleótidos (nt) y contiene cinco pautas de lectura abiertas (ORFs). La ORF más próxima al extremo 5', ORF1, codifica una proteína de 27 kDa y termina con un codón ámbar cuya lectura a través permite continuar la traducción hasta el codón de terminación de la ORF2 dando lugar a una proteína de 86 kDa que contiene los motivos conservados de las RNA polimerasas RNA-dependientes virales (RdRps). Dos pequeñas ORFs, localizadas en la parte central del genoma viral, codifican polipéptidos de 7 (p7) y 12 kDa (p12), respectivamente, los cuales están presumiblemente implicados en el movimiento viral. Cabe destacar que la p12 presenta un motivo de cremallera de leucinas que no ha sido descrito previamente en proteínas relacionadas. La ORF 3'-proximal codifica la proteína de cubierta viral de 37 kDa (CP). El gen de la p12 se encuentra en la misma pauta de lectura que la ORF que da lugar a la p86, por lo que podría ocurrir un doble proceso de lectura a través que daría lugar a una proteína de 99 kDa (p99). Un análisis comparativo de secuencias mostró que la p86, la p7 y la p12 mostraban mayor homología con los productos equivalentes del virus del moteado del clavel (Carnation mottle virus) que con los de otros carmovirus, mientras que la p27 y la CP se asemejaban más a las proteínas correspondientes del virus del cactus Saguaro (Saguaro cactus virus). Los análisis filogenéticos resultantes confirman la adscripción definitiva del PFBV al género Carmovirus.