Evolutionary systems biology of the mycobacterium tuberculosis complex
- Autores: Álvaro Chiner Oms
- Directores de la Tesis: Fernando González Candelas (dir. tes.), Iñaki Comas Espadas (codir. tes.)
- Lectura: En la Universitat de València ( España ) en 2019
- Idioma: español
- Tribunal Calificador de la Tesis: Pilar Francino Puget (presid.), Mireia Coscollá Devís (secret.), Stephen V. Gordon Pym (voc.)
- Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Biomedicina y Biotecnología por la Universitat de València (Estudi General)
- Materias:
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- Tesis en acceso abierto en: TESEO
- Resumen
La tuberculosis es la principal causa de muerte por un único agente infeccioso en el mundo. En el año 2017, la OMS estimó que 1.6 millones de personas murieron por la enfermedad, y 10 millones fueron infectadas. La enfermedad es causada por un grupo de bacterias que pertenecen al llamado complejo de Mycobacterium tuberculosis (MTBC).
En la presente tesis se estudia la diversidad genética del MTBC, su evolución, el uso de cepas referencia para crear modelos computacionales y el efecto de la diversidad sobre los patrones de expresión génica del complejo. Para ello se usan datos de secuencias genómicas de miles de cepas y herramientas bioinformáticas.
De los resultados obtenidos en la presente tesis se concluyen varias cosas. La primera, que no existe recombinación detectable entre miembros del MTBC. Además, se identifica un gen, phoR, como un actor fundamental en la evolución del complejo y en su relación con el hospedador. Segundo, las redes biológicas de la bacteria no están conservadas en los distintos miembros del complejo. Esto hace que modelos computacionales calculados a partir de estas redes y con datos de una única cepa de referencia no sean extrapolables a todo el MTBC. Por último, los diferentes linajes que componen el grupo tienen perfiles transcriptómicos diferentes. Estos perfiles de expresión se ven fuertemente influidos por mutaciones puntuales que generan nuevas cajas Pribnow. Por el contrario, el efecto de la metilación de las regiones reguladoras sobre la expresión génica en este grupo de bacteria es muy sutil.
