El sistema carstico de banyoles presenta en sus diferentes masas de agua poblaciones de bacterias fotosinteticas (identificadas por sus caracteres ultraestructurales y espectro de absorcion de los pigmentos fotosinteticos) pertenecientes a dos familias principales: chromatiaceal con una especie chromatium minus y ehlorobiaceal con tres espacios: chlorobiam limicola chlorobium phaeobacteroides y chlorobium vibrioforme. Las especies dominantes compiten entre si por la luz y el sulfhidrico y experimentan cambios metabolicos importantes dependiendo de los parametros fisico-quimicos del medio. Asi las celulas de chromatiumminus cuando crecen en su medio natural y en condiciones limitantes de luz mantienen su nivel energetico mediante una respiracion anaerobia endogena que comporta el acumulo de poli-b-hichoxibutivato detectable en secciones ultrafinas. Estas celulas presentan bacterias epibrontes que ejercen un papel selectivo sobre la poblacion. El m.E. Ha permitido realizar notables aranas en el campo de la ecologia microbiana.
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