Resumen de Complejidad y conservación de la quasiespecies del virus de la hepatitis b analizada mediante secuenciación masiva en el gen x. Asociación con la actividad replicativa e identificación de regiones híper-conservadas en el genoma viral
El objetivo ideal del tratamiento contra la infección crónica por el virus de la hepatitis B (VHB) es su erradicación, pero esto raramente se logra con los actuales tratamientos antivirales de primera línea. La multifuncionalidad y esencialidad de la proteína X del VHB (HBx) la convierte en una potencial diana terapéutica a bloquear en una terapia génica dirigida. Sin embargo, las inserciones y deleciones descritas en el extremo C-terminal de esta proteína, parecen descartar la región 3’ del gen X como diana para este tipo de terapias, por eso se ha escogido estudiar mediante la tecnología de secuenciación masiva la variabilidad del extremo 5’ del gen X (HBX) para detectar regiones híper-conservadas que puedan sugerirse como dianas para terapia génica dirigida. En esta región se han identificados mediante el análisis del contenido de información, 2 regiones híper-conservadas que podrían ser utilizadas como potenciales dianas terapéuticas para una nueva estrategia basada en el silenciamiento génico, que sea efectiva en todos los estadios clínicos y en presencia de todos los genotipos virales. Además, la proteína HBx, tiene un papel clave en la infección por el VHB y en la progresión de la enfermedad ya que es esencial para iniciar una infección productiva. Por lo tanto, el estudio en profundidad de la conservación/variabilidad, complejidad y variantes específicas de la quasiespecies (QS) del extremo 5’ del gen HBX, en pacientes en diferentes etapas clínicas de la hepatitis crónica B HBeAg (-), podría proporcionar una valiosa información para despejar los mecanismos que permiten controlar la replicación viral. El estudio de la complejidad y la variabilidad de la QS de un grupo de infecciones crónicas HBAge negativo (IC) evidenció, en estos pacientes, una QS viral muchos más sofisticada caracterizada por la presencia de un alto número de haplotipos altamente mutados probablemente a muy bajas frecuencia por lo que no afectan a la conservación. Esto podría sugerir que la mayor sofisticación de la QS viral en los IC sea el primer determinante al baja replicación de VHB en estos pacientes, con la selección de haplotipos más conservados como signo de una menor capacidad de adaptarse al ambiente exterior, llevando por lo tanto a un virus que replica menor. Asimismo, se ha evidenciado un grupo de mutaciones genotipo-específicas. En concreto se ha descrito un patrón mutacional en los haplotipos de genotipo D de los CI asociado a una probable reducción de la expresión viral. Este patrón mutacional genotipo-específico acentúa aún más la necesidad de genotipar adecuadamente el virus en el seguimiento de los pacientes infectados por VHB. Además, el patrón mutacional identificado, podría ser un indicador de baja replicación viral y podría ser útil en la práctica clínica por la correcta clasificación de pacientes.
