Resumen de Molecular and mechanistic characterization of a novel long non- coding rna derived from nbl2 macrosatellite repeats in colorectal cancer
La hipometilación del ADN en elementos repetitivos se ha descrito en casi todos los tipos de tumores estudiados. De alguna manera, esta hipometilación en regiones repetidas conlleva un aumento en la probabilidad de recombinación homóloga precisamente en estas secuencias repetidas y por lo tanto contribuye a la inestabilidad del genoma. Nuestro grupo ha descubierto que un elemento macrosatélite repetido en tándem, perteneciente a la família SST1 y denominado NBL2, se encuentra desmetilado en un subgrupo de cánceres colorectales (CCR) y su hipometilación somática se asocia con el daño genómico, especialmente en tumores que no tienen mutado el gen de la P53 (Samuelsson et al, 2016).
En este proyecto, se ha descrito la localización genómica de NBL2 mediante la combinación de un análisis in silico detallado, la realización de hibridaciones de fluorescencia in situ en metafases y monitorizando por PCR su presencia en el ADN genómico procedente de células híbridas humanas/roedor. Se ha reportado también, que los elementos NBL2 están dispersos en varios cromosomas, pero las concatenaciones en tándem se encuentran cerca de los centrómeros y más concretamente en los brazos cortos de los cromosomas acrocéntricos 13, 14, 15 y 21. Por otra parte, se ha caracterizado la transcripción procedente de NBL2 y se han intentado averiguar las posibles funciones que el ARN de NBL2 podría tener en el contexto del CCR. Se ha determinado la existencia de un nuevo ARN largo no codificante (lncRNA) que se transcribe únicamente a partir de los cromosomas 13, 14, 15 y 21 cuando su ADN se desmetila y además presenta sus histonas acetiladas. La transcripción del elemento NBL2 genera tres lncRNA con uno de alto peso molecular (4.2, 10 y 13 kb). Estos tránscritos son retenidos en el núcleo, en donde se acumulan preferencialmente en la región perinucleolar. Para estudiar las vías intracelulares donde la ARN de NBL2 podría estar involucrado y determinar su posible función y/o contribución al proceso oncogénico, se monitorizó su interacción con proteínas, realizando una purificación por afinidad seguida de un análisis proteómico mediante espectrometría de masas. Estos resultados han mostrado que el ARN de NBL2 se une con alta afinidad a varias proteínas implicadas principalmente en el metabolismo del ARN. Entre estas, destaca CELF1, una proteína que regula el procesamiento del pre-ARN mensajero (ARNm) y la estabilidad de la ARNm maduro.
En relación a los resultados generados, se propone un modelo en el cual la hipometilación somática del ADN de NBL2 contribuiría al daño genómico mediante la producción de un lncRNA, el cual secuestrando proteínas implicadas en el metabolismo del ARN, jugaría un papel clave en la desestabilización de una serie de ARNm diana de las proteínas secuestradas. Así pues, los elementos repetidos NBL2 podrían ser importantes en la generación de la inestabilidad genómica subyacente a la patogénesis del cáncer de colon mediante el incremento del riesgo de dicha inestabilidad debido a una desmetilación somática presente en las células precursoras del cáncer, o favoreciendo la inestabilidad durante la progresión tumoral. La transcripción aberrante que se ha reportado a partir de estos elementos NBL2 repetitivos en forma de lncRNA podría contribuir en ambas vías.
