Evolutionary analysis of the genome load of loss-of-function variants and their contribution to immunodeficiencies
- Autores: Guillem de Valles Ibáñez
- Directores de la Tesis: Tomàs Marques-Bonet (dir. tes.), Ferran Casals López (codir. tes.)
- Lectura: En la Universitat Pompeu Fabra ( España ) en 2016
- Idioma: español
- Tribunal Calificador de la Tesis: Juan I. Aróstegui (presid.), Elena Bosch Fusté (secret.), Roger Colobran Oriol (voc.)
- Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Biomedicina por la Universidad Pompeu Fabra
- Materias:
- Texto completo no disponible (Saber más ...)
- Resumen
Recientemente se ha determinado que los genomas humanos contienen un número inesperadamente alto de variantes que causan pérdida de función (LoF, de loss-of-function en inglés), del orden de 100, 20 de las cuáles son homocigotas, sin que provoquen un efecto visible en la mayoría de los casos a pesar de la potencial abolición de la proteína que conllevan. Esto sugiere que algunas de estas variantes deben ser neutrales, pero también que una fracción de éstas pueden ser alelos letales. En este trabajo se estudia la implicación de las variantes LoF en dos campos distintos: en la genómica comparativa mediante la exploración pionera de la carga mutacional de variantes LoF segregando en 79 genomas pertenecientes a 6 especies diferentes de grandes simios y sus posibles efectos perjudiciales, y en la genómica medica por su implicación, junto a la de otras variantes funcionales, in 36 pacientes diagnosticados con Immunodeficiencia Común Variable (CVID), una enfermedad heterogénea con varios genes implicados en su etiologia, usando tanto modelos monogénicos como oligogénicos para el estudio de esta deficiencia de anticuerpos.
