Estrategias para el estudio del genoma de p. Pinaster

• Autores: Rocío Bautista Moreno
• Directores de la Tesis: Manuel Gonzalo Claros Díaz (dir. tes.), Francisco Miguel Cánovas Ramos (codir. tes.)
• Lectura: En la Universidad de Málaga ( España ) en 2008
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Pedro María Aparicio Tejo (presid.), Francisco J. Ruiz Cantón (secret.), María Dolores Abarca Sanchis (voc.), Guillermo Pérez Trabado (voc.), María Teresa Cervera Goy (voc.)
• Materias:
  • Química
    • Bioquímica
  • Ciencias de la vida
    • Genética
      • Ingeniería genética
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• Resumen

  • El pino presenta uno de los genomas más grandes y complejos del reino vegetal, la especie modelo utiliza en este trabajo es el P. pinaster. Para poder estudiar su genoma es necesario disponer de forma física de su ADN construyendo una genoteca genómica completa. Realizar esta tarea cuando se trabaja con genomas grandes y complejos es muy complicado ya que se requiere un gran número de clones para disponer de una genoteca representativa. Para facilitar esta trabajo se ha optado por la utilización de los vehículos artificiales de bacterias (BAC) ya que permiten la clonación de insertos de gran tamaño. Hemos optimizado un método para la construcción de una genoteca BAC de P. pinaster en el vector pindigo BAC536, la genoteca parcial está formada por 72.192 clones con un tamaño medio de inserto de 107 kb. Hemos demostrado que la genoteca construida es válida para el rastreo con genes de interés para el investigador. De la misma forma, hemos construido una genoteca BAC de P. pinaster organizada en grupos de células que ocupa un espacio físico muy inferior. Esta genoteca está formada por 83 grupos de células que representan 332.000 clones con un tamaño medio de inserto de 107 kb, hemos validado la genoteca en grupos de células con genes de interés. En el rastreo de ambas genotecas se han identificado una serie de clones BAC con secuencia codificante para la Fd-GOGAT y para una quitinasa de clase I. En resumen, hemos optimizado un método para el estudio de genomas grandes y complejos como el que presenta el genoma del pino.