Resumen de Desarrollo de una plataforma automatizada de aislamiento mediante Dilución a Extinción para el cribado de bacterias no filamentosas productoras de compuestos con actividad antitumoral
Las bacterias marinas suponen una extraordinaria fuente de compuestos bioactivos. Sin embargo, el continuo redescubrimiento de las mismas o similares entidades químicas, obliga a realizar cambios de estrategia para poder llegar a compuestos novedosos de interés. Más allá de la elicitación de la biosíntesis de moléculas codificadas por agrupaciones génicas crípticas, otra estrategia de gran interés es la optimización del crecimiento “in vitro” de grupos bacterianos de difícil aislamiento mediante métodos clásicos, en un intento de superar el paradigma de lo que se conoce como “Great Plate Count Anomaly”, y poder aumentar así la fracción de bacterias cultivables. En este trabajo se ha desarrollado por vez primera una plataforma de aislamiento basada en la estrategia de Dilución a Extinción (DTE, de las siglas en inglés “Dilution to Extinction”) para el aislamiento de bacterias copiotrofas Gram negativas no filamentosas productoras de compuestos con actividad antitumoral. La plataforma integra desde el aislamiento de estos organismos de interés a partir de muestras marinas, hasta el cribado de las cepas para la detección de la actividad antitumoral. Todo el proceso se lleva a cabo de forma automatizada, permitiendo su empleo como sistema de aislamiento y cribado de alto rendimiento. Para el desarrollo del método, fue seleccionada una esponja marina de la que se había obtenido mediante aislamiento en medio sólido una cepa de Labrenzia alexandrii productora del novedoso antitumoral labrenzina. Además de permitir fijar los parámetros necesarios, el aislamiento de esta muestra mediante la nueva plataforma sirvió como prueba de concepto al lograr el cultivo de tres nuevas cepas activas pertenecientes al mismo género Labrenzia, dos de ellas productoras de labrenzina y una tercera productora de otro compuesto antitumoral, la sesbanimida. Las nuevas cepas productoras de labrenzina obtenidas, presentaban además una diferente capacidad de acumulación del compuesto labrenzina en el caldo de cultivo. Tras la prueba de concepto, 70 muestras adicionales fueron procesadas mediante DTE, logrando el aislamiento de cepas con actividad antitumoral pertenecientes a 19 géneros distintos e identificando hasta 12 familias de compuestos diferentes. Además, se han aislado nueve bacterias productoras de biomoléculas con actividad citotóxica que no derreplican con ningún compuesto conocido, pudiendo pertenecer a grupos taxonómicos no descritos (similitud de secuencia 16S <97.5%), lo cual las hace especialmente interesantes. Estos resultados respaldan la utilización de este sistema para aislamientos masivos de este tipo de bacterias
