Evaluación molecular de bioindicadores y patógenos procariotas. Usos y aplicaciones

• Autores: Marina Carrasco Acosta
• Directores de la Tesis: Pilar García Jiménez (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad de Las Palmas de Gran Canaria ( España ) en 2021
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Angel Luque Escalona (presid.), María Nieves Elvira González Henríquez (secret.), David Osca Ferriol (voc.)
• Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Calidad Ambiental y Recursos Naturales por la Universidad de Las Palmas de Gran Canaria
• Materias:
  • Ciencias de la vida
    • Microbiología
      • Bacteriología
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  • Tesis en acceso abierto en: acceda
• Resumen

  • En esta tesis se han diseñados cebadores y optimizado procedimientos para la valoración del gen 16S rRNA tanto grupo- como especie-específicos para distintos bioindicadores tales como Escherichia/Shigella, Enterococcus spp, Enterococcus faecalis y Enterococcus faecium, y para los patógenos Salmonella spp y Legionella spp. Estos diseños y procedimientos han sido implementados en dos sistemas bien diferenciados. Por un lado, las membranas de ósmosis inversa y por otro, las salinas costeras. En estas aplicaciones se han reportado a los géneros Sphingomonas y Pseudomonas en las membranas de ósmosis inversa como los grupos mayoritarios, mientras Halobacterium, Halorubrum y Salinibacter lo han sido en los ambientes extremófilos. Estos resultados abren un marco de trabajo interesante para el estudio de estos géneros de procariotas, tanto en la formación de biopelículas como en la síntesis de compuestos bioactivos de interés. A continuación, a partir de los perfiles de restricción de los genes marcadores 16S rRNA y lacZ, se han evaluado los cambios en las estructuras poblacionales bacterianas. La aplicación de este trabajo en humedales ha revelado estas modificaciones cuando se comparan los sistemas naturales de depuración con plantas y sin plantas, lo que nos ha permitido reconocer el sistema con el mejor rendimiento. Se propone gracias al desarrollo de este estudio el uso de reactores de depuración, basados en sustratos orgánicos y con plantas, por la capacidad de biorremediación que manifiestan. Finalmente, la detección y cuantificación simultánea de bioindicadores de contaminación fecal mediante multiplex a tiempo real, usando genes codificantes como el ybbW y no codificantes como el 16S rRNA, ha sido otro hito alcanzado en este trabajo. Así, el desarrollo e implementación de este método, en agua y sedimentos marinos, ha permitido la evaluación espacio-temporal de los bioindicadores valorados, evidenciándose que los sedimentos marinos son un reservorio importante para los bioindicadores fecales. A través de los resultados obtenidos en este trabajo, se propone la inclusión de los sedimentos marinos en las labores de monitorización de las zonas de baño para obtener un mayor conocimiento del estado de la calidad de sus aguas. En resumen, la identificación y caracterización molecular de bioindicadores y patógenos procariotas, en diferentes ambientes, ha permitido ahondar en el conocimiento de las bacterias y arqueas para el control y gestión de procesos de índole microbiológica que repercuten en el medioambiente y en nuestra sociedad.