Resumen de Three dimensional similarity of melecules with biological interest on the basis of molecular interaction potentials
- español
Una de las areas más prometedoras en investigación biomédica i farmacéutica es el diseño molecular computacional, que intenta establecer relaciones entre propiedades físico-químicas y actividad biológica.
El éxito de estas técnicas depende críticamente de la calidad de la descripción molecular. En este sentido, metodologías basadas en potenciales de interacción molecular (MIP) son herramientas útiles para lac omparación de compuestos quepresenten comportamientos biológicos parecidos.
Este proyecto desarrolla herramientas para comparar moleculas basadas en la caracterización de MIPs. El programa de similaridad molecular MIPSim ha sido desarrollado y aplicado a diferentes problemas biológicos.
Esta tesis consiste en cuatro estudios científicos que muestran el uso del MIPSim en alineamiento molecular, catalisis enzimática,para buscar modos de unión al ligando y en estudios 3D-QSAR.
- català
Una de les àrees més prometedores en recerca biomèdica i farmacèutica és el disseny molecular computacional, que intenta establir relacions entre propietats físico-químiques i activitat biològica. L'èxit d'aquestes tècniques depen críticament de la qualitat de la descripció molecular. En aquest sentit, metodologies basades en potencials d'interacció molecular (MIP) són eines útils per la comparació de compostos que presenten comportaments biològics semblants. Aquest projecte desenvolupa eines per comparar molècules basades en la caracterització de llurs MIPs. El programa de similaritat molecular MIPsim ha estat desenvolupat i aplicat a diferents problemes biològics. Aquesta tesi consisteix en quatre estudis científics que mostren l'ús del MIPSim en aliniament molecular, catalisi enzimàtica, en acoratge de molècules dins el lligand i en estudis 3D-QSAR.
- English
One of the most promising areas in biomedical and pharmaceutical research is computer assisted molecular design, which tries to stablish relationships between physicochemical properties and biological activity. The success of these techniques depends critically on the quality of the molecular description. In this sense, methodologies based on molecular interaction potentials (MIP) are useful tools for the comparison of compounds displaying related biological behaviours. This project aims to develop tools to compare 'molecules based on the characterization 'of their MIPs. To this end, the molecular similarity program MIPSim has been further developed and applied to different biological problems. This thesis consists on four scientific studies showing the use of MIPSim for molecular alignment, enzymatic catalysis, ligand-protein docking and 3D-QSAR analyses.
