Natural antinsense transcripts control LEF1 gene expression
- Autores: Estel Aparicio Prat
- Directores de la Tesis: Antonio García de Herreros Madueño (dir. tes.)
- Lectura: En la Universitat Pompeu Fabra ( España ) en 2014
- Idioma: inglés
- Tribunal Calificador de la Tesis: Maite Huarte Martínez (presid.), Rory Baldwin Johnson (secret.), Isabel Puig Borrell (voc.)
- Materias:
- Enlaces
- Tesis en acceso abierto en: TDX
- Resumen
- español
La transición epitelio-mesénquima es un proceso típico del desarrollo embrionario con implicación en procesos tumorales. Este proceso está caracterizado por la represión transcripcional de la E-caderina. El factor de transcripción Snail1 es el encargado de llevar a cabo esta represión y la activación de genes mesenquimales tal como LEF1. En los últimos años, las funciones ejercidas por los ARN no codificantes están creciendo. Hasta el momento se sabe muy poco de como los ARNs no codificantes pueden regular la transición epitelio-mesénquima, así que nuestro principal objetivo para esta tesis fue investigar la regulación de este proceso mediante ARNs no codificantes.
En esta tesis se describe un Transcrito Antisentido Natural (NAT) que controla la expresión del factor de transcripción LEF1. Este NAT de LEF1 es transcrito desde el promotor que se encuentra en el primer intrón de LEF1 y se procesa mediante splicing en células mesenquimales. En las células epiteliales no hay expresión del NAT de LEF1. No obstante, en las células epiteliales que inician la Transición Epitelio-Mesénquima (EMT), una parte significativa del NAT no se procesa y, contrariamente al NAT que ha sido procesado, disminuye la actividad del principal promotor de LEF1, disminuyendo así la expresión de LEF1 a nivel de ARN y proteína. Además, el NAT que no ha sido procesado también disminuye la migración celular e incrementa la expresión de la E-caderina. El NAT de LEF1 interacciona con el promotor de LEF1 y se une físicamente con Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) induciendo su unión al promotor de LEF1 y trimetilando la Lisina 27 de la Histona 3. El NAT de LEF1 que ha sido procesado previene la unión entre el NAT que no lo ha sido y el promotor de LEF1, previniendo la represión del promotor de LEF1.
Así pues, estos resultados indican que la expresión de LEF1 está finamente controlada por el procesamiento del NAT de LEF1 que, cuando no ha sufrido splicing, recluta PRC2 al promotor de LEF1 para inhibirlo.
Para la realización de esta tesis se ha usado la bibliografía biomédica existente en Pubmed, así como bases de datos como la NATs Database.
- català
En els darrers anys, les funcions exercides pels ARN no codificants estan creixent. En aquesta tesi es descriu un Natural Antisense Transcript (NAT) que controla l’expressió del factor de transcripció LEF1. Aquest NAT de LEF1 és transcrit des del promotor que es troba al primer intró de LEF1 i es processa mitjançant splicing en les cèl·lules mesenquimals. En les cèl·lules epitelials no hi ha expressió del NAT de LEF1. No obstant, en les cèl·lules epitelials que inicien la Transició Epiteli-Mesènquima (EMT), una part significativa de NAT no es processa i, contràriament al NAT que ha estat processat, fa baixar l’activitat del principal promotor de LEF1 i disminueix l’expressió de LEF1, a nivell d’ARN i proteïna. A més, el NAT que no ha estat processat també disminueix la migració cel·lular i incrementa l’expressió de l’E-caderina. El NAT de LEF1 interactua amb el promotor de LEF1 i s’uneix físicament amb Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) induint-ne la seva unió al promotor de LEF1 i trimetilant la Lisina 27 de l’Histona 3. El NAT de LEF1 que ha estat processat prevé la unió entre el NAT que no ho ha estat i el promotor de LEF1, prevenint la repressió del promotor de LEF1. Per tant, aquests resultats indiquen que l’expressió de LEF1 està finament controlada pel processament del NAT de LEF1 que, quan no ha patit splicing, recluta PRC2 al promotor de LEF1 per inhibir-lo.
- English
Non-coding RNA functions are emerging in the recent years. In this thesis we describe a Natural Antisense Transcript (NAT) that controls the expression of LEF1 transcriptional factor. This LEF1 NAT is transcribed from a promoter present in the first LEF1 intron and undergoes splicing in mesenchymal cells. In epithelial cells, there is no expression of LEF1 NAT. However, in metastable epithelial cells, LEF1 NAT is transcribed and a significant part of it remains unspliced and, contrarily to the spliced NAT, down-regulates the main LEF1 promoter and LEF1 mRNA and protein expression. Moreover, unspliced NAT also down-regulates cell migration and up-regulates Ecadherin expression. Unspliced LEF1 NAT interacts with LEF1 promoter and physically associates with Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2) inducing its binding to the LEF1 promoter and trimethylating Lysine 27 in Histone 3. Spliced LEF1 NAT prevents the binding between unspliced LEF1 NAT and LEF1 promoter, inhibiting LEF1 promoter repression. Thus, these results indicate that LEF1 gene expression is finely controlled by splicing of the LEF1 NAT that, when is not processed, recruits PRC2 to LEF1 promoter to inhibit it.
- español
