Efecto fundador en el conglomerado genético geográfico de síndrome X frágil de Ricaurte-Valle del Cauca

• Autores: Julián Andrés Ramírez Cheyne
• Directores de la Tesis: Wilmar Saldarriaga Gil (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad del Valle (Cali) ( Colombia ) en 2019
• Idioma: español
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en: hdl.handle.net
• Resumen

  • Ricaurte es un corregimiento del municipio de Bolívar ubicado al norte del Departamento del Valle del Cauca donde se presenta un conglomerado geográfico genético de síndrome X frágil. Los casos se concentran en tres núcleos familiares en los cuales se identificaron tres parejas fundadoras de la población, por lo que se ha propuesto un efecto fundador como causa de la alta prevalencia de la enfermedad en la población. Por tanto, se planteó este estudio para, a través del análisis de SNPs obtenidos mediante secuenciación exómica de 54 pacientes del clúster y un individuo normal, confirmar o descartar la presencia del efecto fundador. Se encontró un haplotipo común de 33 SNPs comprendido en 83.567.899 pb circundantes a FMR1 en todos los hombres de Ricaurte portadores de la expansión, con lo cual se comprobó que el conglomerado genético de síndrome X frágil en Ricaurte se debe a un efecto fundador. Además, se hicieron algunos análisis exploratorios iniciales, sobre aspectos que constituirán objetivos de investigaciones posteriores más profundas, encontrando que los individuos analizados presentan SNPs en desequilibrio de H-W en todos los autosomas, lo cual es esperado por tratarse de una población pequeña y aislada socialmente por el conglomerado X frágil. Sin embargo, el coeficiente de endogamia es negativo. Al comparar los individuos de este estudio con los de 1000 genomas, los individuos de Ricaurte y zonas aledañas portadores de la expansión, se ubicaron con los colombianos de 1000 genomas, más cercanos a Europa, América y Asia que a África. Se encontraron siete variantes tipo SNP, en seis genes, significativamente más frecuentes en individuos expandidos (mutación completa o premutación) con convulsiones. Solamente las ubicadas en el gen PTCHD3 pasaron Bonferroni. Se encontraron 12 variantes tipo SNP, en 9 genes, significativamente más frecuentes en mujeres expandidas (premutadas) con falla ovárica prematura. Solamente la ubicada en el gen TRPM3 pasó Bonferroni. Se encontraron 15 variantes tipo SNP, en 11 genes, significativamente más frecuentes en individuos expandidos (premutación) con temblor-ataxia. Ninguna pasó Bonferroni.