EN EL VIRUS DE LA FIEBRE AFTOSA DE SEROTIPO C HAY TRES SITIOS ANTIGENICOS INDEPENDIENTES. EN EL SITIO A EXISTE UNA COMPLEJA DINAMICA CON LA APARICION Y DESAPARICION DE EPITOPOS, ADEMAS ESTA IMPLICADO EN EL RECONOCIMIENTO POR EL RECEPTOR CELULAR. EN EL SITIO D EXISTEN FUERTES RESTRICCIONES ESTRUCTURALES A LA VARIACION Y LA FRECUENCIA DE FIJACION DE SUSTITUCIONES DE AMINOACIDO ES UN ORDEN DE MAGNITUD INFERIOR QUE EN EL SITIO A. LA VARIACION ANTIGENICA EN ESTE SEROTIPO ES DEBIDA A SUSTITUCIONES DE AMINOACIDO EN UNAS POCAS POSICIONES CRITICAS EN CADA UNO DE LOS SITIOS ANTIGENICOS IDENTIFICADOS, AQUELLAS QUE SON MAS TOLERANTES AL CAMBIO.
EN EL SITIO A CAMBIOS EN DOS POSICIONES CRITICAS Y CONSERVADAS PRODUCEN CAMBIOS MUY DRASTICOS DE ESPECIFICIDAD ANTIGENICA. EL VIRUS C GC ES EL AISLADO MAS ANTIGUO DE ESTE SEROTIPO Y CONSTITUYE UNA LINEA EVOLUTIVA PROBABLEMENTE EXTINTA. ESTE ES UN CLARO EJEMPLO DE FALTA DE CORRELACION ENTRE DISTANCIA GENETICA Y ANTIGENICA.
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