El análisis de una genoteca de Streptomyces clavuligerus, previamente construida, empleando una sonda homóloga al gen hlmA (acetiltransferasa) permitió localizar la agrupación génica de holomicina y, posteriormente, aislar la agrupación de biosíntesis de holomicina completa que consta de 13 marcos de lectura (genes). Los experimentos de transcriptómica realizados en este trabajo demostraron que los genes hlm fueron claramente sobre expresados en las cepas productoras de holmicina en comparación con la cepa silvestre S. clavuligerus ATCC 27064.
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