EPIDEMIOLOGÍA DE LA COLONIZACIÓN POR PNEUMOCYSTIS EN POBLACIÓN GENERAL Directores: Francisco Javier Medrano Ortega, Enrique Calderón Sandubete Tutor: Eduardo Lissen Otero Doctorando: Rosa María Yang Lai Antecedentes: El conocimiento sobre la epidemiología de la infección humana por Pneumocystis jirovecii es aún muy limitado, y no están bien establecidos cuales son sus reservorios y fuentes de transmisión. En estudios preliminares se ha demostrado la presencia del patógeno en el árbol respiratorio de sujetos adultos sanos inmunocompetentes. Sin embargo, en el momento actual la magnitud y relevancia de este fenómeno es desconocida.
Objetivo: El objetivo general del presente estudio fue conocer las características epidemiológicas de la colonización por Pneumocystis en la población general. Sus objetivos específicos fueron: determinar la prevalencia de colonización por Pneumocystis en la población general de un área del sur de España; investigar posibles factores asociados a una mayor tasa de colonización por el patógeno; estudiar la distribución de genotipos del patógeno en la población general y la prevalencia de sujetos colonizados con mutaciones asociadas a la resistencia al cotrimoxazol.
Métodos: Se realizó un estudio transversal de prevalencia de base poblacional. La población estudiada fue el municipio de El Coronil. El tamaño muestral se realizó mediante un muestreo sistemático con arranque aleatorio.
Tras consentimiento informado por escrito de los participantes se realizó una valoración clínico-epidemiológica estandarizada, que incluyó analítica básica y perfil inmunológico, y se obtuvieron muestras de lavado orofaríngeo para la detección de dos loci independientes del genoma de P. jirovecii: el gen de la subunidad mayor del ribosoma mitocondrial (mtLSU rRNA), mediante PCR anidada y el gen que codifica la síntesis de la enzima dihidropteroato sintetasa (DHPS), mediante PCR ¿touchdown¿. La colonización se definió como detección de ADN de P. jirovecii en el árbol respiratorio en un sujeto sin síntomas o signos de neumonía. En los sujetos colonizados se realizó la caracterización genotípica de Pneumocystis para el gen mtLSU rRNA mediante secuenciación directa y para el gen DHPS mediante la identificación de polimorfismos según la longitud de los fragmentos obtenidos con enzimas de restricción específicas (RFLP), técnica que permite detectar la presencia de mutaciones asociadas a resistencia a cotrimoxazol.
Resultados: Los individuos participantes fueron 169, un 89,42% del tamaño muestral calculado. La prevalencia de colonización por P. jirovecii fue del 13,02%. No se observaron diferencias en la distribución de las diferentes variables sociodemográficas, clínicas y biológicas entre los sujetos colonizados y no colonizados, salvo en los niveles de hemoglobina que resultaron significativamente más elevados en los individuos colonizados. Los genotipos identificados fueron para el locus mtLSU-rRNA el tipo 3 (90%) y el tipo 1 (10%) y para el locus DHPS el tipo 1 ó silvestre (80%) y el tipo 3 con una mutación en la posición 57 asociada a resistencia a cotrimoxazol (20%).
Conclusiones: 1) En este estudio se ha demostrado por primera vez la existencia de una elevada prevalencia de colonización por P. jirovecii, que se sitúa en el 13% (7,9-18%), en adultos inmunocompetentes de nuestra área concordante con la hipótesis de que la población general podría ser un importante reservorio y fuente de transmisión de esta infección; 2) No se ha encontrado asociación entre la presencia de colonización y las diferentes variables demográficas y clínico-biológicas evaluadas salvo en el caso de la hemoglobina, cuyos niveles resultaron más elevados en los pacientes colonizados, aunque la explicación biológica de este hallazgo es incierta; 3) El patrón de genotipos observado en la población general, con predominio del genotipo 3 (90% de los casos), es diferente al descrito previamente en pacientes colonizados y con PcP en el ámbito hospitalario, lo que refuerza la idea de la existencia de diferentes circuitos de transmisión; 4) Por primera vez se ha descrito la presencia de mutaciones en el gen de la DHPS asociadas a resistencia a sulfamidas en sujetos sanos no inmunocomprometidos que alcanzó un 20% de los casos. Este hecho, observado en personas no tratadas con sulfamidas refuerza la idea de la posible transmisión de P. jirovecii con mutaciones del gen de la DHPS entre personas; 5) En conjunto nuestros resultados indican que la población general humana es un reservorio para P. jirovecii y apoya que forma parte del ciclo de vida de este microorganismo.
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