Las bacterias Gram-negativas del suelo pertenecientes a los géneros Azorhizobium, Bradyrhizobium Mesorhizobium, Sinorhizobium, Allorhizobium y Rhizobium, establecen una relación simbiótica con plantas leguminosas promoviendo la organogénesis del nódulo de la raíz. En estos nuevos órganos vegetativos, el nitrógeno atmosférico es reducido a amonio que se usa como fuente de nitrógeno en el metabolismo de las plantas. Una de las propiedades más importantes de esta interacción simbiótica es la especificidad, en la que al menos dos etapas de intercambio de señales moleculares entre la planta y la bacteria, aparecen implicadas en la determinación de la nodulación específica con el huésped. En la primera, los flavonoides, moléculas señal excretadas por la planta, activan la proteína de nodulación NodD que induce la transcripción de los genes de nodulación bacterianos (llamados genes nod, nol, noe). Estos genes de nodulación codifican las proteinas Nod, enzimas que están implicadas en la biosíntesis de las moléculas señal de la bacteria también llamados factores Nod. Los factores Nod son oligosacáridos de N-acetil-D-glucosamina (2-6 unidades) enlazadas por uniones B-(1->4) y N-aciladas por un ácido graso de naturaleza variable en el terminal no reductor. Pueden presentar diversos tipos de sustituyentes tanto en el terminal reductor como en el terminal no reductor, la naturaleza exacta de estos sustituyentes varia ampliamente según la bacteria y juegan un papel determinante en su actividad biológica. 1. Se ha estudiado la estructura de los factores de nodulación de Rhizobium giardinii bv. giardinii H152.
Se han utilizado las técnicas avanzadas de determinación estructural: CGL-EM, FAB, ES Q-o-TOF, CID ES Q-o-TOF y 1H- y 13C-RMN (experimentos DBF-COSY, 1D-TOCSY, HSQC-ed, HMBC, 1D-NOESY). Además, se ha efectuado el análisis de los O-trimetilsililderivados de los metil glicósidos, análisis por metilación,
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