El virus de la Hepatitis C o VHC es un ARN virus perteneciente al género Hepacivirus, dentro de la familia Flaviviridae, causante de la hepatopatía crónica más prevalente a nivel mundial, con una afectación en nuestro país de aproximadamente 1 millón de españoles, cuyo tratamiento actual se basa en el uso de la terapia combinada de interferón pegilado más ribavirina, el cual alcanza la curación de la enfermedad en el 40-60% de los casos, pero que debido al importante volumen de efectos adversos derivados de dicho tratamiento, es necesario determinar predictores de respuesta que nos permitan individualizar el tratamiento a cada paciente con el objetivo de minimizar efectos adversos y asegurar el mayor porcentaje de respuesta virológica posible. En este sentido, en este trabajo se ha investigado la influencia de la variabilidad genética de la región ISDR en NS5a del ARN-VHC (Región determinante de la sensibilidad al Interferón), y su posible influencia sobre la respuesta al tratamiento con interferón pegilado (PEG-IFN). Para ello se ha puesto a punto la técnica de secuenciación bidireccional con primers marcados con fluoróforos capaces de emitir luz en dos longitudes de onda distinta en los dos sentidos de lectura 5¿-3¿ y 3¿-5¿; que son sometidos a un programa de termociclador de 45 ciclos, donde la temperatura de rotura de los puentes de hidrógeno y posterior temperatura de hibridación fueron ajustados por genotipo. La secuencia específica de aminoácidos de cada aislado viral analizado se obtiene a través del cromatograma que nos proporciona el someter a una reacción de electroforesis en gel de poliacrilamida del producto de secuenciación, para posterior alineamiento de secuencias con determinadas cepas de referencia para cada genotipo viral.
Se analizarán dos poblaciones de pacientes diferentes, cuya diferencia fundamental será la coinfección por los virus VHC y VIH (n=40), o solo infectados por el virus VHC (N=51). Se ajustarán las comparativas de respuesta viral por genotipos en ambas poblaciones, para finalmente aplicar los distintos porcentajes de respuesta al número de mutaciones acumuladas en la región ISDR de NS5a del ARN del VHC. En ningún caso se detectó significación estadística que relacionara la variabilidad genética basal en ISDR con la posterior respuesta al tratamiento con interferón pegilado más ribavirina, ni de forma global, ni estratificando por genotipos, ni distinguiendo entre pacientes VIH positivos o negativo. Por tanto, concluimos que la variabilidad genética en ISDR no es una variable predictora de respuesta para el tratamiento de interferón como tratamiento de la hepatopatía crónica por VHC.
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