La tesi doctoral tiene como ejes vertebradores la sistemática molecular, la biogeografía y la filogeografía molecular. Para esta tesis doctoral se han seleccionado dos grupos principales de plantas, que pertenecen a dos famílias diferentes: una parte del género Euphorbia, de la família de les Euphorbiaceae y la tribu Cardueae, de la família de las Compositae. Se escogieron estos dos grupos porque incluyen un gran número de espécies y porque presentan interesantes cuestiones a resolver y que nos han permitido comprobar la aplicabilidad de los métodos más actuales y contrastar los resultados con las propuestas tradicionales, basadas en caracteres morfológicos. En el caso del género Euphorbia, se ha investigado el subgénero Esula y en concreto un grupo incluido en este, el grupo Pachycladae. La circumscripción y las afinidades filogenéticas de este grupo y otras espécies relacionadas, entre ellas la sección Tirucalli no habían podido ser esclarecidas en anteriores estudios moleculares. El primer artíclo de la tesi tiene como objetivo principal recircumscribir estos grupos para establecer una nueva clasificación que refleje las verdaderas relaciones filogenéticas. Este trabajo se ha realizado mediante análisis de Máxima Parsimónia y de Inferéncia Bayesiana de secuencias de DNA nuclear y cloroplástico. El segundo objetivo es confirmar si el grup estudiado sigue el paradigmático patrón fitogeográfico de la denominada Rand Flora, que incluye grupos muy diversos de plantas que presentan una distribución disyunta entre la Macaronesia, el cuerno de África, el sud de la península Arábiga y el sud de África, y explicar las posibles causas de esta distribución. El grupo Pachycladae incluye numerosas espécies distribuidas en cuatro de los cinco archipiélagos macaronésicos y en dos localidades continentales de esta región. El grup de espécies macaronésicas obtenido de los análisis del primer trabajo se ha analizado mediante el uso de los marcadores AFLP para estudiar la filogeografía y la taxonomia de las espécies. En el caso de la tribu Cardueae existían ya distintas filogénias moleculares publicadas, pero tenían algunas carencias referentes al muestreo y a la resolución de los grupos basales. El tercer artículo de la tesi tiene com objetivos construir una nueva filogénia molecular basada en más marcadores moleculares y un muestreo más exhaustivo que en trabajos anteriores, para responder algunas cuestiones sistemáticas no resueltas y también realizar una reconstrucción biogeográfica de la tribu, que presenta una distribución subcosmopolita con distintos ejemplos interessants de disyunciones entre áreas lejanas. Este trabajo incluye diversas novedades metodológicas como el uso de fósiles descubiertos recientemente, del concepto del reloj molecular relajado y de métodos bayesianos de reconstrucción biogeográfica. Dentro de las Cardueae, se ha explorado de manera particular el grupo Plectocephalus en un cuarto trabajo para tratar de resolver cuestiones sistemáticas y biogeográficas.
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