Development of computational tools to assist in the reconstruction of molecular networks
- Autores: Ana Isabel Usié Chimenos
- Directores de la Tesis: Rui Carlos Vaqueiro de Castro Alves (dir. tes.), Francesc Solsona Tehàs (dir. tes.)
- Lectura: En la Universitat de Lleida ( España ) en 2014
- Idioma: inglés
- Tribunal Calificador de la Tesis: A. Sorribas Tello (presid.), Alexandra Sofia Trinidade Rodrigues Da Silva Moura (secret.), Miguel Vázquez García (voc.)
- Materias:
- Enlaces
- Tesis en acceso abierto en: TDX
- Resumen
L'objectiu d'aquesta tesi és desenvolupar i implementar un conjunt d'eines de mineria de dades per ajudar en la reconstrucció de circuits biològics a través de l'anàlisi i la integració de grans conjunts de dades biològiques. Aquests circuits són importants perquè regulen tots els processos que controlen la vida i la salut dels organismes. El treball principal de la tesis es centra en l'anàlisi de les dades bibliòmiques desenvolupant-se dues eines, Biblio-MetReS per la reconstrucció de xarxes de PPIs i la identificació dels processos en què intervenen aquestes xarxes, i CheNER per la identificació de noms de compostos químics. L'eina final desenvolupada es centra en la integració de mètodes per a l'anàlisi estructural i modelització de proteïnes amb mètodes d'acoblament per a la predicció de complexos físics de proteïna-proteïna.
