Aislamiento de microRNAs a partir de células clorofílicas de Bouteloua gracilis y su caracterización in silico
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Perla Lucía Ordóñez-Baquera [1] ; Everardo González- Rodríguez [1] ; Gerardo Armando Aguado-Santacruz ; Quintín Rascón-Cruz [1] ; Eduviges Burrola-Barraza [1]
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[1] Universidad Autónoma de Chihuahua
Universidad Autónoma de Chihuahua
México
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- Localización: Revista Mexicana de Ciencias Pecuarias, ISSN 2007-1124, ISSN-e 2448-6698, Vol. 7, Nº. 3, 2016, págs. 263-274
- Idioma: español
- Títulos paralelos:
- Isolation of microRNAs from Bouteloua gracilis chlorophyllous cells and their in silico characterization
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Resumen
Bouteloua gracilis es un pasto nativo del norte de México, que es utilizado como fuente de forraje para el ganado por su alto contenido nutritivo; tiene elevada tolerancia al estrés osmótico que le permite vivir en climas secos; sin embargo, los mecanismos moleculares que le confieren esta tolerancia aún no se han reportado. Existe una clase de RNAs pequeños (sRNAs) llamados microRNAs (miRNAs), que se unen por complementariedad a RNAs mensajeros blanco, etiquetándolos para su degradación o supresión de la traducción. En este trabajo se reporta el aislamiento de sRNAs de B. gracilis, a través de la clonación de concatámeros y su secuenciación. El análisis in silico de la secuencias, permitió la identificación de miRNAs conservados en B. gracilis y reportados en Populus trichocarpa, Brachypodium distachyon, Oryza sativa, Sorghum bicolor, Zea mays, Malus domestica y Linum usitatissimum. Además, se predijo la estructura secundaria de los precursores de dos miRNAs (pre-miRNAs), usando como referencia los genomas de Glycine max, Zea mays, Sorghum bicolor y Oryza sativa. Finalmente, se identificaron seis mRNAs blanco para uno de ellos. La identificación de miRNAs en Bouteloua gracilis, ayudará a comprender como estas moléculas regulan la expresión genética en esta especie, y sus relaciones con los mecanismos de respuesta a estrés ambiental.
