Tecnologías transcriptómicas y su potencial en la gestión del chancro resinoso del pino

• Zamora-Ballesteros, C. ^[1] ; Martín-García, J ^[1] ; Diez, J.J. ^[1]
  1. [1] Sustainable Forest Management Research Institute, University of Valladolid—INIA
• Localización: Cuadernos de la Sociedad Española de Ciencias Forestales, ISSN 1575-2410, ISSN-e 2386-8368, Nº. 49, 2, 2023, págs. 133-148
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Transcriptomics technologies and their potential for pine pitch canker management
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• Resumen
  • español

    El chancro resinoso del pino es una grave enfermedad que afecta a Pinus spp. y Pseudotsuga menziesii en todo el mundo. Varios factores han contribuido a la propagación de la enfermedad a todos estos continentes, siendo el más importante el comercio internacional de material vegetal de reproducción. A pesar de su importancia, no se dispone de medidas eficaces para erradicar o controlar la enfermedad ni en los viveros ni en el monte. En esta tesis se llevó a cabo una recopilación de información actual sobre las vías de propagación del patógeno, proponiendo mecanismos preventivos para evitar su introducción en zonas libres de la enfermedad. Proponemos más investigación sobre el posible papel de los micovirus como agentes de control biológico, explorando nuevos métodos de transfección con micovirus de F. circinatum. Utilizamos las tecnologías transcriptómicas que, además de permitirnos estudiar el efecto de un micovirus en su hongo hospedante a nivel molecular, nos proporcionaron información útil sobre los genes, las transcripciones, y sus funciones asociadas a las interacciones planta-patógeno. Mediante el uso de RNA-Seq y especies susceptibles y resistentes a F. circinatum, identificamos los genes y vías metabólicas asociados a caracteres de resistencia de la enfermedad y presentamos un mapa completo de los ARNlnc durante la infección del patógeno. Nuestros hallazgos sobre los mecanismos reguladores implicados en la defensa de los hospedantes permitirán la optimización de los programas de mejora genética para la comercialización de pinos resistentes al PPC.

  • English

    Pine pitch canker (PPC) is a serious disease affecting Pinus spp. and Pseudotsuga menziesii worldwide. Several factors have contributed to the spread of the disease to all these continents, the most important being the international trade in plant reproductive material. Despite its importance, no effective measures are available to eradicate or control the disease either in nurseries or in the field. In this thesis, a compilation of current information on the pathways of spread of the pathogen was carried out, proposing preventive mechanisms to avoid its introduction into disease-free areas. We propose further research on the possible role of mycoviruses as biological control agents, exploring new methods of transfection with F. circinatum mycoviruses. We used transcriptomics technologies that, in addition to allowing us to study the effect of a mycovirus on its host fungus at the molecular level, provided useful information on genes, transcripts, and their functions associated with plant-pathogen interactions. Using RNA-Seq and susceptible and resistant species to F. circinatum, we identified genes and metabolic pathways associated with disease resistance traits and presented a comprehensive mapping of lncRNAs during pathogen infection. Our findings on the regulatory mechanisms involved in host defence will allow the optimisation of breeding programmes for the commercialisation of PPC-resistant pines.