Desde sus inicios la gestión de las pesquerías no fue diseñada de manera sostenible y hoy en día la mayoría de las especies marinas comerciales están sobreexplotadas. En consecuencia el tamaño censal de sus poblaciones se ha erosionado dramáticamente, provocando un aumento de la endogamia y la reducción de su tamaño efectivo. Por tanto, para su adecuada gestión y recuperación es fundamental la información sobre la diversidad genética que permanece en la naturaleza después de la sobreexplotación, así como la reversibilidad de la deriva fenotípica provocada por sobrepesca. De esta forma, la correcta delimitación de las unidades biológicas de gestión es básica para la óptima explotación y sostenibilidad de los recursos marinos. Sin embargo, la definición de los límites de las unidades de gestión pesqueras continúa basándose en la jurisdicción territorial de los distintos estados antes que en las evidencias biológicas existentes, siendo el fiel reflejo de las necesidades prácticas administrativas en vez de la realidad biológica de las especies. Un enfoque genético para el amaláis de las poblaciones, sería más adecuado y proporciona un elevado número de marcadores y herramientas que pueden emplearse para revelar el trasfondo molecular de los fenómenos biológicos más complejos que afectan a las especies marinas. Identificando de forma adecuada los stocks pesqueros y corrigiendo el déficit de conocimiento intrapoblacional. En la actualidad existen una gran cantidad de herramientas genéticas disponibles y cada vez se emplean con mayor frecuencia en la investigación pesquera. Como los microsatélites y los marcadores desarrollados a partir del ADN mitocondrial usados principalmente en el análisis de la estructura genética de los principales taxones marinos explotados. Por el contrario, marcadores clásicos como las alozimas, AFLPs, genoma mitocondrial, RAPDs y RFLPs han sido mucho menos empleados en la última década tras la aparición de los marcadores derivados de las tecnologías NGS (Next Generation Sequencing) que se obtienen más rápido y a menor coste. La Merluza Europea es una de las especies demersales explotadas más importantes en los mercados europeos, su elevada demanda y su alto valor económico, han provocado el declive de sus pesquerías. Por tanto se han implementado diversas medidas para frenar el deterioro de sus poblaciones y fomentar su recuperación. Siendo un recurso tan importante, en este estudio se ha evaluado el espaciador intergénico de transcripción ITS1-ADNr en una serie temporal de merluza europea (1976, 2000 ¿ 2005 y 2007) con el fin de evaluar el comportamiento molecular e la evolución de la diversidad genética frente a los procesos de sobreexplotación pesquera, tal como la ejercida históricamente sobre esta pesquería. Por medio de este marcador ribosómico ITS1, se ha encontrado que la población atlántica de merluza se está recuperando de la sobrepesca histórica, lo cual es congruente con otros trabajos efectuados tanto con marcadores estrictamente neutrales como con otros pseudo-selectivos. Además, usando marcadores microsatélites neutros para estimar Ne y datos demográficos para calcular Nc y Ne/Nc a lo largo de un periodo de 30 años. Se han encontrado dato interesantes que sugieren un un modelo de conectividad global en el Atlántico con su origen en las zonas de desove en Porcupine Bank y Gran Sole y que irradian multidireccionalmente. Además con este de acuerdo con ese modelo poblacional, las costas ibéricas ocupadas por el Stock Sur de Merluza Europea se enriquecen genéticamente gracias a las migraciones periódicas provenientes del Stock Norte. Toda esta información acerca de la estructura genética poblacional de la Merluza Europea permite entender mejor las limitaciones de los modelos demográficos y a su vez es clave para evaluar los riesgos de extinción por factores genéticos permitiendo incorporar criterios de estructuración genética en la gestión y de esta forma prevenir la erosión del background genético de esta especie.
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