Síndrome de cáncer de mama y ovario hereditario: Estudio in vitro de variantes BRCA1 y BRCA2 de significado biológico desconocido y búsqueda de nuevos genes responsables de este síndrome

• Autores: Francisco de Asis Quiles Vidal
• Directores de la Tesis: Conxi Lázaro García (dir. tes.)
• Lectura: En la Universitat de Barcelona ( España ) en 2016
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Daniel Grinberg Vaisman (presid.), Judith Balmaña (secret.), Laura Valle Velasco (voc.)
• Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Biomedicina por la Universidad de Barcelona
• Materias:
  • Ciencias de la vida
    • Biología humana
    • Biología vegetal (botánica)
  • Ciencias médicas
    • Salud publica
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en: Dipòsit Digital de la UB
• Resumen

  • Antecedentes: Entre un 20-25% de pacientes con cáncer de mama y ovario hereditario muestran historia familiar de dicha enfermedad. Un porcentaje de estos casos es debida es debida a mutaciones en genes de predisposición y se considera hereditario. Mutaciones en los genes de alta penetrancia BRCA1/2 explican menos de un 20% de los casos familiares. No obstante, el estudio mutacional de estos genes identifica un alto porcentaje de variantes cuyo significado biológico es desconocido (VSD), no pudiendo ser utilizadas para el diagnóstico genético. El porcentaje de VSD detectadas en BRCA1/2 varía entre 2-15% dependiendo de la población analizada y la casuística del laboratorio que las reporta. Modelos de distintos tipos pueden ser utilizados para clasificar este tipo de variantes (modelos genéticos, histopatológicos, funcionales, epidemiológicos o multifactoriales). Por otra parte, mutaciones de alta, moderada o baja penetrancia se han identificado en otros genes y con ellas se ha podido explicar una pequeña porción de los casos restantes. Muchos de estos genes han sido identificados por estar involucrados en la vía de reparación de DNA de FA/BRCA, o por ser interactores de BRCA1/2. Con todo esto, más de un 50% de los casos familiares de alto riesgo permanecen sin explicación genética (estos casos son comúnmente conocidos como casos BRCAX). En este contexto, el uso de las nuevas técnicas de secuenciación de exomas combinadas con ensayos de interacción entre proteínas ha demostrado ser una estrategia válida para la identificación de genes BRCAX. Objetivo: El objetivo global de esta tesis doctoral es mejorar el diagnóstico genético y el consejo genético de los pacientes con síndrome de cáncer de mama y ovario hereditario (SCMOH). Para ello, se plantearon dos estrategias, la clasificación de VSD en BRCA1/2 identificadas en pacientes con sospecha de SCMOH y la búsqueda de genes de predisposición este a este síndrome. Resultados: Cuarenta VSD en BRCA1/2 fueron analizadas siguiendo diferentes metodologías, Veintiocho de ellas fueran analizadas a nivel transcripcional y 6 (4 en BRCA1 y 2 en BRCA2) fueron clasificadas como probablemente patogénicas. Siete variantes más localizadas en la región C-terminal de BRCA1 fueron analizadas mediante el ensayo de actividad transcripcional. Tres de estas variantes pudieron ser clasificadas como probablemente patogénicas. Posteriormente, una de estas variantes, G1770V sué identificada por nuestro grupo como la primera mutación fundadora de origen Marroquí. Las cinco restante, situadas en BRCA2, fueron analizadas mediante el ensayo funcional basado en células embrionarias de ratón. Todas ellas mostraron un efecto hipomórfico y fueron asociadas a un riesgo bajo/moderado a sufrir cáncer d mama y/o ovario. Por otra parte, en la búsqueda de nuevos genes se utilizaron dos aproximaciones. Por un lado, se resecuenciación dos genes candidatos pertenecientes a la vía de FA, ERCC4 y SLX4. Este estudio identificó varias variantes missense nuevas en cada gen. Varias de ellas fueron clasificadas como potencialmente deletéreas por varios programas de predicción in silico. No obstante, la validación funcional de estas variantes es necesaria para elucidar su asociación con el SCMOH. Como segunda aproximación, se secuenció el exoma de varios pacientes pertenecientes a familias BRCAX con un aparente patrón de herencia autosómico dominante. Como resultado, se identificaron 20 genes potencialmente candidatos para ser genes de predisposición al SCMOH. Entre ellos, POLE destaca como firme candidato. Conclusión: Este trabajo, en su conjunto, contribuye a la mejora del diagnóstico y consejo genético mediantes la identificación de nuevas variantes de predisposición en al SMCOH en los genes BRCA1/2 y la identificación de nuevos genes candidatos al SCMOH.